2000年12月14日,省教育厅和省发展计划委员会联合下文,批准学校为省部级重点中专校。省部级重点评估结束以后,我校于2001年9月第一次招收药物制剂技术五年制高职专业学生53名,从此开始了向高等职业教育迈进的步伐。
2003年11月6日,江苏省教育厅苏教发[2003]178号文件批准建立江苏省徐州医药高等职业学校。2004年4月16日,徐州四所高等职业学校共同举行揭牌庆典。